跨境电商企业在深圳办理营业执照的流程大致可以分为几个步骤。首先，成立一家进出口贸易公司，如果已有符合条件的公司则无需重新注册。其次，需要在跨境电商平台开设账户。接着，进行一系列的海关备案工作，包括对外贸易经营备案、向检验检疫局和海关提交相关资料，以及在电子口岸开户。对于境内跨境电商企业，备案需要提供以下材料：跨境电子商务经营主体备案信息表、营业执照、组织机构代码证、质量诚信经营承诺书、消费者自用承诺声明主要要求、ICP备案号或电信增值业务许可证、进出口商品质量保证承诺书以及不合格商品召回承诺。而境外跨境电商企业则需要提交不同的材料，具体包括跨境电子商务经营主体备案信息表、营业执照、组织机构代码证、质量诚信经营承诺书、消费者自用承诺声明主要要求、ICP备案号或电信增值业务许可证。

跨境电商企业的备案分为境内和境外两个类别，两者在申请资料上有一定的差异。境内企业的备案流程和所需材料相对固定，包括上述提到的几项主要资料。而境外企业则需要提供额外的材料，以证明其运营资质和遵守相关法律法规的能力。在准备这些材料时，企业需要确保所有信息的真实性和准确性，以便顺利完成备案流程。

跨境电商企业办理营业执照的过程中，还需要注意遵循相关法律法规的要求，确保企业运营的合法性和合规性。这不仅有助于提高企业的信誉度，还能避免因违规操作而产生的法律风险。因此，在准备备案材料的同时，企业也应加强对相关法律法规的学习和理解。