根据福建农林大学官网查询知。

1、地理位置不同。农林大学安溪校区，位于福建省泉州安溪县，本部是金山校区，位于福建省福州仓山区。

2、开设专业不同。安溪校区开设有专业茶学、商务经济学、管理科学、会计（茶学院）。金山校区除了上述其它专业4年都在金山校区（本部）。