广州工商学院在广东省内拥有两个校区，分别是花都校区和三水校区。它们在地理位置、校园规模、专业设置和学校文化等方面存在差异。

首先，地理位置是两校区的一大不同点。花都校区位于广州市花都区新华街，距离广州市中心较远，而三水校区则位于佛山市三水区，距离广州市也有一定距离。

其次，在校园规模上，花都校区的占地面积比三水校区大，且校园内建筑建设更为完善，设有图书馆、学生公寓、教学楼等多个教学和生活设施。相比之下，三水校区的规模较小，建筑设施相对简单。

此外，专业设置方面，两个校区的专业设置也有所不同。花都校区的专业以商科为主，同时也有一些工科和艺术类专业；而三水校区的专业则以工科、理科和医学类专业为主。

最后，学校文化也是两校区的一大区别。花都校区注重创新创业和国际化教育，鼓励学生积极参与社会实践和创业项目；而三水校区则强调学生的实践能力和科研能力，鼓励学生参与科学研究和学术活动。

总的来说，虽然花都校区和三水校区在地理位置、校园规模、专业设置和学校文化等方面存在差异，但它们都是广州工商学院的重要组成部分。