在小升初阶段，业余围棋段位对申请学校的重要性因学校性质而异。如果学生的围棋段位是5段，这在私立学校中可能被视为一种加分因素，在录取过程中起到一定作用。然而，对于公立学校而言，现在的入学制度多采用摇号方式，因此围棋的等级证书参考价值相对有限。

尽管如此，如果学生持续参与围棋训练并取得优异成绩，这些经历和成果在日后的升学中仍然具有积极意义。围棋不仅能够培养学生的逻辑思维和战略规划能力，还能提升他们的心理素质和专注力。因此，对于那些愿意在围棋上投入时间和精力的学生来说，这段经历无疑会为他们的个人发展和未来学习提供助力。

此外，围棋作为一种传统的智力竞技项目，其培养的不仅仅是技艺，更是一种全面素质的提升。它能够促进学生的耐心、毅力以及团队合作精神。这些软技能在小升初乃至更长远的教育和职业生涯中都将发挥重要作用。

总的来说，虽然业余围棋5段在某些特定情况下可能被视作加分项，但其长远价值在于对学生综合素质的培养，这对于他们的未来成长至关重要。