依据《国家税务局关于印花税若干具体问题的解释和规定的通知》（91国税发155号）规定：“在代理业务中，代理单位与委托单位之间签订的委托代理合同，凡仅明确代理事项、权限和责任的，不属于应税凭证，不贴印花”。因此，如果外贸企业与委托人签订的代理合同仅明确代理事项、权限和责任的，不属于应税凭证，不贴印花

凡是明确承、托运双方业务关系的运输单据均属于合同性质的凭证。规定以运费结算凭证作为各类货运的应税凭证。凡直接办理承、托运运费结算凭证的双方，均为货运凭证印花税的纳税人。税目“货物运输合同”。按运输费用万分之五贴花。

因此，物流公司开具的代理运费发票（6％的增值税税票）需要计提缴纳印花税。