中小企业在转型期的战略财务分析着重于优化资源配置，提升企业价值。财务职责主要分为四大部分：战略财务、专业财务、业务财务和财务核算与税收筹划。战略财务涉及人财物的合理配置，支持公司目标的实现；专业财务涵盖融资、并购、投资分析等；业务财务则配合业务部门工作，如预测、分析与预算，为决策提供数据支撑；财务核算和税收筹划则通过资源的有效配置提升企业价值。

转型期的企业需要降低成本，提高产品竞争力，为未来扩张做准备。在组织架构调整上，建议设立研发部、销售部、生产部、行政部（人力资源、行政事务、物流）、采购部、财务部（财务会计、管理会计、信息）和审计部。财务部应建立公司的数据中心，推动数据共享平台的建设，并主导梳理业务流程，确保信息的透明性与准确性。审计部应由董事会直接领导，以确保独立性与公正性。财务总监由董事会聘任，薪酬由董事会决定，但需向总经理汇报工作，确保财务决策的合规性与透明性。

薪酬体系应根据岗位的重要性、目标的大小、工作难度设置，体现岗位价值。对于关键岗位，应考虑岗位的成长性与可培养性，合理设定薪酬。激励机制需科学设计，激发员工积极性，实现多劳多得。人才培养与薪酬体系密切相关，需同步规划。

在组织架构与薪酬体系确定后，应建立全面预算制度，设定各部门目标与资源支撑需求。各部门负责人提出部门预算，经营团队评估后报董事会批准执行。预算设定后，考核重点转向业务指标，以支撑财务指标的实现。

关键考核指标应紧密关联预算目标，例如：研发中心关注新产品上市率、销售的产品结构；销售中心强调销售额、毛利率、回款等；生产中心关注毛利率、材料利用率、合格率、投诉率、返工率；行政中心关注关键人才流失率、出货速度；采购部关注原材料质量、毛利率、应付账款周转率；财务部则关注税前利润、财务费用等。这些指标提供了一个框架，企业可根据自身情况进行调整与优化。

中小企业转型期的战略财务分析旨在通过优化资源配置、调整组织架构、完善薪酬体系与建立全面预算制度，实现企业价值的提升与可持续发展。此分析仅供参考，企业需根据自身情况灵活调整与实施。