吉林省商务厅按照其主要职责，内部设有多部门，各司其职。以下是部分重要职能处室的概述：

办公室: 负责制定工作制度，处理文电、会议、新闻、政务信息和督查等工作，管理机关行政事务，接待群众并负责财务经费管理。

人事教育处: 管理厅机关和下属单位的机构编制、人事、劳动工资、社会保障及驻外人员选派，指导商务系统职工的教育培训。

政策法规调研处: 研究国内外贸易法规，起草地方性法规，协调重大经贸协议，分析市场形势并提出建议，负责行政复议和诉讼工作。

规划财务处: 制定中长期规划，监测运行状况，编制资金计划并管理，负责国内外贸易统计和国有资产运营。

东北亚处: 专注于对朝鲜、韩国、日本和蒙古的贸易发展，推动区域进出口和国际合作。

这些部门各自承担着贸易政策执行、市场分析、国际交流、外资引进、公平贸易保护、信息化建设以及口岸管理等关键职责，共同推进吉林省商务工作的全面开展。