深圳大学总体上分后海校区和西丽校区。

后海校区在南山区南海大道3688号，后海校区又分北校区和南校区，两校区之间就隔了一条白石路，有天桥相连，北校区是主体，主要是文科，艺术及行政教务等，南校区主要是理工科类学院。

西丽校区深位于南山区西丽与宝安区的交界处，西侧为环境优美的西丽高尔夫球会，东侧为南方科技大学，预计2017年第一期工程投入使用后，医学部、生命与海洋科学学院、材料学院和化学与环境工程学院4个学院将会搬到西丽校区。

后海校区到西丽校区开车大概半小时。