一、整体角度不同：

“财务报表层次”可以理解为财务报表的整体角度。“认定层次”可以理解为财务报表的具体认定，例如交易和事项、期末余额以及列报。不同的具体认定就构成了财务报表的整体层次。

二、描述的对象不同：

财务报表层次是从财务报表整体来说的，不能归为某个具体的认定，而认定层次是针对某个具体的项目来说的，比如存货等。

三、错报风险认定不同：

财务报表层次重大错报风险与财务报表整体存在广泛联系，它可能影响多项认定。此类风险通常与控制环境有关，如管理层缺乏诚信、治理层形同虚设而不能对管理层进行有效监督等。

但也可能与其他因素有关，如经济萧条、企业所处行业处于衰退期。

在财务报表重大错报风险的评估过程中，注册会计师应当确定，识别的重大错报风险是与特定的某类交易、账户余额、列报的认定相关，还是与财务报表整体广泛相关，进而影响多项认定。

如果是后者，则属于报表层次的重大错报风险。如果是前者，则属于认定层次重大错报风险。

参考资料来源：百度百科-针对评估的重大错报风险实施的程序

参考资料来源：百度百科-重大错报风险