1.细菌性污染

常见的有沙门菌、变形杆菌、肉毒杆菌、金黄色葡萄球菌等，主要污染食品为变质的肉、蛋、奶、豆制品、发馊的饭菜或冷饮；而肉毒杆菌污染的是火腿、腊肉、罐头、臭豆腐等。

2.霉菌性污染

常见的有黄曲霉毒素等，污染的食品主要为霉变的米、麦、花生、玉米等。

3.寄生虫性污染

常见的有绦虫污染的猪肉、牛肉，姜片虫和肺吸虫的卵，囊蚴污染的荸荠、蟹、虾等。

4.病毒性污染

常见的有甲型肝炎病毒污染的毛蚶。

5.农药残留

包括谷物、蔬菜、水果、蛋、奶、肉等食品中残留的有机磷农药、有机氯农药、有机汞农药等。