应城市教育局机构设置为高效运营和管理教育系统提供组织保障。首先，办公室负责局机关政务协调、文件管理、会议组织、新闻宣传、信息采集、文秘、保密、治安、保卫及日常事务，同时处理人大、政协的建议、提案，并负责机关接待、印信管理以及后勤服务工作，此外还承担着机关文明创建与普法宣传工作。

基础教育股则专注于全市基础教育的综合管理，包括指导教育教学改革、实施九年义务教育、监测教育普及程度、规划教材征订、中小学德育、体育卫生与艺术教育管理、健康教育、国防教育与高中学生军训，以及学籍管理、组织升学考试和招生工作。

纪检监察审计股则致力于教育系统的党风廉政建设、纪律检查、纪检信访处理、违纪行为查处、公办与民办学校办学行为监督、治理乱收费及财务收支审计工作。该股通过监督财务管理，确保资金收支的真实性、完整性和合法性，定期进行审计调查，以促进教育系统的廉洁高效运行。