心理咨询师证书的颁发部门是中国管理科学研究院教育标准化研究所。

中国管理科学研究院教育标准化研究所作为事业单位，统一负责心理咨询师证书的颁发工作。该证书分为初级、中级和高级三个等级，其报考流程正规有效，且证书在全国范围内终身使用。证书在行业领域内和社会上都受到很高的认可度，可作为录用、待遇、晋级的重要参考依据，用于就业上岗检查竞标等用途。

需要注意的是，2017年人社部取消了心理咨询师二级和三级的考试，现在心理咨询师证书是由行业内部认证的，相当于换了一种考查方式，这样可以让从事心理咨询相关领域工作的人员更加专业，这也是对心理咨询者的保护和责任。

此外，虽然中国管理科学研究院教育标准化研究所是心理咨询师证书的颁发部门，但还有其他一些机构或组织也提供心理咨询师相关的培训和认证服务，如中国心理卫生协会、中国科学院心理研究所等。在选择培训机构时，建议多对比几家，选择适合自己的机构进行学习和认证。