根据中国会计网查询可知，补交增值税税款分期补交的方式如下：

1.与税务机关协商：如果纳税人需要补交的税款金额较大，无法一次性补交，可以向税务机关申请分期缴纳税款。税务机关会根据纳税人的财务状况、纳税记录等情况，综合评估纳税人的还款能力，并制定还款计划，与纳税人协商确定分期缴纳的具体方式和期限。

2.按时缴纳：需要注意的是，分期缴纳税款必须按照约定的方式和期限及时缴纳，否则可能会被视为逾期未缴税款，需要承担相应的法律责任。