执业药师继续教育费用各地不同，从20元至550元不等，一般由注册单位承担。

江苏省于2018年2月宣布所有执业药师参加继续教育无需付费，并已将此前所交费用返还。吉林省部分地区也已取消执业药师继续教育费用。

《执业药师继续教育管理试行办法通知》第十八条指出，继续教育费用可适当收取，以补偿成本为原则，不以盈利为目的，收费不能过高。

执业药师资格证书与注册证书不同，注册证书有效期五年，需定期延续注册，延续注册时必须提供继续教育学分。执业药师拿证后，基本每年都要参与继续教育。