监理主要控制的程序包括：

一、项目决策与设计审查程序

监理在项目决策和设计阶段扮演着关键角色。监理人员需要对项目的设计方案进行审查，确保其符合规划要求、安全标准及相关法规。这一阶段，监理主要控制设计质量和设计进度，确保设计方案的经济性、合理性和可行性。

二、施工招标与承包管理程序

在项目施工之前，监理需要参与施工招标过程，确保招标过程的公正、透明。同时，监理还要对承包商的资质、能力进行评估和审查，以保证项目施工的质量和进度。这一阶段，监理的主要任务是控制招标流程，确保选择到合适的承包商。

三、施工质量控制程序

在施工过程中，监理负责对施工质量进行全程监控。这包括对施工材料、设备、施工工艺及施工方法进行监督和管理。监理人员需进行现场检查，确保施工质量符合设计要求和相关标准。一旦发现质量问题，监理需要及时要求承包商进行整改。

四、工程进度与投资控制程序

监理还需要对项目的进度进行控制，确保工程按计划进行。同时，监理要参与项目的成本控制，对项目的投资进行合理控制。这需要监理人员定期审查施工进度报告和费用预算，确保项目在规定的时间和预算内完成。

五、竣工验收与档案整理程序

在项目竣工阶段，监理需组织各方进行竣工验收，确保工程各项指标达到设计要求和质量标准。此外，监理还需负责整理项目档案，包括施工过程中的各种文件、资料等。这一阶段的监理工作，是对整个项目成果的总结和评估。

监理在项目中扮演监督和管理的重要角色，涉及从项目决策到施工再到竣工的各个环节。通过控制上述程序，监理确保了项目的顺利进行，实现了项目目标的有效管理。