前者在全国内地各个医疗机构注册后可以取得合法执业资格，拥有处方权，同时职称取得为：医师。助理注册后只有在乡镇一级卫生院具有处方资格，在其他等级机构需要执业医师指导下处置病人。可以理解为助理约等于以前的医士。

而且没有执业医师资格，无法取得更高的职称报考资格。