目前施工现场管理员的证书都是需要进行审核、身份证采集的，所以公司留下证书没有对应的身份证也是没用的。不过也不排除公司会扣下证件的情况，如果有遇到这种情况，可以采取以下方式：

到当地劳动局申请劳动仲裁或者到当地劳动监察部门进行投诉。

向发证机构申请证书挂失，重新办理证书后到新单位重新注册。

和原公司协商，考证时花费的培训费或者考试费结算给公司以换取证书。