专硕与在职研究生在性质上存在显著差异，前者是一种硕士学位类型，而后者则是一种报考方法。专硕旨在培养具备深厚理论基础和适应特定行业或职业的高层次应用型专门人才，其教育目标更加注重学术与实践的结合。在职研究生则主要面向在职人员，允许他们在保持工作的同时进行学习，这种灵活性使得在职人员能够兼顾职业发展和个人成长。

在报名条件方面，专硕对考生的要求更为严格，不仅需要具备一定的工作经验，还要求得到所在单位或相应管理部门的同意，有些专硕项目甚至需要单位推荐。相比之下，报考在职研究生的门槛较低，大专及以上学历的在职人员都可以报名参加，有些项目甚至不对工作经历做出具体要求。

入学方式也是两者的重要区别之一。专硕无论是选择全日制还是非全日制，都需要通过入学考试才能被录取，这体现了对学术能力的严格要求。而在职研究生则提供了更为灵活的选择，既可以参与入学考试，也可以直接通过资格审核的方式入学，这种多样性为不同背景的在职人员提供了更多的入学途径。

总体而言，专硕和在职研究生在培养目标、报名条件以及入学方式等方面存在显著差异。专硕更侧重于学术研究和理论学习，而在职研究生则更强调在职人员的实践应用能力，两者各有优势，适合不同类型的考生。