自然损耗计入科目：成本或管理费用。

自然损耗是指在储存或生产过程中发生的物资数量的正常损失。针对自然损耗的会计处理，需要根据具体情况进行分析。一般来说，自然损耗可以计入以下两个科目：

首先，自然损耗可能计入产品成本中。在生产过程中发生的原材料自然损耗，应当视为生产成本的正常组成部分。这部分损耗直接与生产活动相关，应将其计入相应的产品成本中。

其次，对于存货的自然损耗，如果损耗数量较小且属于日常管理范畴，可以将其计入管理费用中。管理费用是企业为组织和管理生产经营活动而发生的费用，包括一些日常损耗和损失。

总的来说，自然损耗的会计处理需要根据具体情况进行具体分析。无论是计入成本还是管理费用，都需要遵循会计原则和规定，确保会计处理的准确性和合规性。在实际操作中，企业应根据自身的业务特点和会计政策来确定自然损耗的会计处理科目。