真菌感染具有多种特点，主要根据其侵犯人体部位的不同分为四个类别：浅表真菌病、皮肤真菌病、皮下组织真菌病和系统性真菌病。浅表真菌病包括前两者，而深部真菌病则涵盖了后两者。真菌不仅局限于皮肤和皮下组织，还会深入到组织和器官，甚至导致广泛的播散性感染，这类被称为侵袭性真菌感染。

近年来，随着医疗技术的进步和药物的广泛应用，如高效抗生素、免疫抑制剂等，以及器官移植、导管技术的普及，以及AIDS等疾病的出现，条件性致病真菌引发的系统性真菌病发病率显著上升，新病原体不断涌现，使得疾病形势变得更为严峻。

医学上，致病真菌主要指霉菌，它们根据侵犯人体的深度分为浅部真菌和深部真菌。例如，真菌性肠炎属于深部真菌病，它能侵入内脏，甚至导致全身性播散。在某些情况下，如婴儿的念珠菌肠炎或艾滋病并发的播散性组织胞浆菌病，深部真菌感染可能单独表现，也可能作为全身性感染的一部分。