院与系的区别体现在定义、分类与制度上。首先，系指学校依据专业性质设立的教学组织，学院（College、Institute或Academy）则多指专业性强、科目较少的高等教育机构。其次，从分类角度看，高等学府通常分设多个系，系内设有相似专业；学院作为独立学校，同时拥有二级学院或与社会组织或个人合作建立的独立学院。最后，制度方面，实行学院制的学校，在学院下设系，系下为专业，专业下是班级；系制则是在学校下设系，系下为专业，专业下为班级。