南京新港经济开发区有6家制药企业。南京新港经济开发区有金陵制药厂、南京美瑞制药有限公司、南京臣功制药股份有限公司、南京原子高科医药有限公司、南京制药厂有限公司、南京新百药业有限公司6家制药厂。