北大软微学院学费相对较高，一般家庭可能难以承受。以2022级全日制MEM为例，学费标准为9.9万元，分两年两次缴清。而非全日制的学费则更高，达到18.8万元，同样分两年交清。北京大学软件与微电子学院，作为建设一流大学规划中的新型学院，采用了新模式和新机制运行。它实行理事会领导下的院长负责制，探索多元合作办学模式。与国内外企业合作，吸引社会资金投入，学院的运作模式更显企业化、办学专业化和后勤社会化特色，旨在培养出高层次的人才。