从工资中扣款可以按罚款或者补助津贴来做会计分录；

1、用人单位可以从劳动者工资中扣除应当扣除的款项；

2、工资应当及时足额的进行发放。

3、工资罚款

借：现金

贷：营业外收入

1、你说的是《工资支付暂行规定》（劳部发[1994]489号）第十六条的规定，因员工本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可以要求员工赔偿经济损失。赔偿金额可从员工工资中扣除，但每月扣除的金额不能超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余的工资不能低于最低工资标准。

2、根据《上海市劳动合同条例》第五十五条的规定：劳动合同当事人违反劳动合同的，应当承担相应的责任。给对方造成经济损失的，应当承担赔偿责任。根据《〈上海市劳动合同条例〉实施细则》第二十五条的规定：劳动合同当事人违反劳动合同的，应当承担相应的责任。给对方造成经济损失的，应当按照实际损失承担赔偿责任。双方当事人对赔偿金的支付方式另有约定的，从其约定。