南通本科大学包括三所，分别是：

2 南通理工学院，位于江苏南通，属于本科层次，是民办学校。

3 南通大学杏林学院，同样位于江苏南通，本科层次，同样为民办学校。

南通专科院校则有两所，它们为：

1 江苏工程职业技术学院，位于江苏南通，是公办专科院校。

2 南通职业大学，同样位于江苏南通，也是公办专科院校。