深圳普通民办学校年级第三可以考上高中。

根据深圳市教育局的规定，深圳普通民办学校的学生在完成初中阶段的学业后，是可以参加高中阶段的升学考试的。深圳市教育局明确规定，民办学校的学生可以参加与公办学校同等的高中升学考试，只要达到相应的考试成绩要求，就有机会被录取到深圳市的高中学校。因此，深圳普通民办学校年级第三的学生是可以考上高中的。