1998年9月1日，经龙岩市政府批准，新创办的漳平第三中学开学招生。后与菁城中学、铁路中学合并成为一所完全中学。

2011年又与漳平三中、和平中学合并。

初中部位于原菁城中学校址（福满路46号）。

高中部位于原铁路中学校址。（现已取消高中部，新校区建好会复校）

2012年秋季开始，漳平三中高中部与漳平二中合并，漳平三中高中部不再存在，漳平三中自此不是完全中学。