东南大学数学系与南京师范大学数学系比较，各有特色与优势。东南大学作为985重点院校，其科研与教学水平均属一流。其数学系研究领域侧重理工科学科，展现出较高的专业深度与广度。而南京师范大学作为211重点院校，其科研与教学亦是一流水平，值得肯定。因此，东南大学数学系与南京师范大学数学系均属优秀院校，值得参考。