区别很大，中医的生理学理论以唯物辩证法和阴阳五行为基础，认为构成人体的基本物质是，气、学、津液、精，中医的三焦理论在现代解剖学（西医）中是没有的，西医以细胞、分子、组织、体液等为基础，西医说的比较具体和明确，中医讲究整体观念。