少数民族聚居区实施的是民族区域自治制度，这一制度确保了在这些地区生活的少数民族能够在维护国家统一的前提下，行使自治权力，保留和发展其独特的文化、语言和宗教信仰。

民族区域自治是在国家的统一领导下进行的，它允许各少数民族在其传统居住地设立自治机关，行使自治权。这种制度的行政级别与中国的省级、市级和县级行政单位相对应。

然而，实施民族区域自治也面临着一些挑战：

1. 经济发展不平衡：一些少数民族聚居的地区由于历史和地理等原因，经济发展相对滞后。如何通过民族区域自治政策促进这些地区的经济发展，是一个需要解决的问题。

2. 文化保护与传承：少数民族的文化和传统是其自治的核心。但在现代化进程和文化交流中，这些文化面临着保护和传承的挑战。

3. 民族融合与社会稳定：民族区域自治旨在促进民族团结和和谐，但现代社会的交流和移民流动也带来了新的挑战。如何在保持民族特色的同时促进民族融合，确保社会稳定，是需要考虑的问题。