职责重点不同，工作方式不同。

1、职责重点不同：医院纪检科主要关注党风廉政建设和反腐败工作，而经营管理科则侧重于医院的运营管理和资源配置。

2、工作方式不同：医院纪检科主要通过组织传达上级会议精神、监督检查、受理信访举报等方式进行工作，而经营管理科则通过资源配置评估与建议、后效评价与反馈、成本核算、成本控制、经营分析、绩效分配等方式进行工作。