从签证顺序上看，你当前在美的身份是F1。移民局应该按你现在的身份办理。J1身份已成历史，而你又没有违法记录的话，他们不会去追究你的J1签证情况。J1回国两年服务要求是通则，你勾选了或没勾选应该不会影响你现在的身份。