吉林大学管理学院和商学院在多个方面存在显著的区别。

首先，两个学院的专业方向和研究重点有所不同。管理学院主要侧重于管理学的各个方面，如工商管理、公共管理、人力资源管理等，强调理论研究和实际应用相结合。而商学院则更注重商业领域的研究，如市场营销、财务管理、国际商务等，更强调商业实战和商业创新。

其次，两个学院的课程设置和教学方法也存在差异。管理学院的课程设置相对更广泛，涵盖了管理学的各个领域，教学方法注重培养学生的综合素质和实践能力。而商学院的课程设置则更加专业化和深入，教学方法更加强调商业案例分析和实战演练，以培养学生的商业思维和实际操作能力。

最后，两个学院的师资力量和研究方向也有所不同。管理学院的师资力量相对更加雄厚，拥有更多国内外知名学者和专家，研究方向也更加广泛和深入。而商学院的师资力量则更加注重商业实战和商业创新，拥有更多具有商业背景和实战经验的教师，研究方向也更加侧重于商业领域的前沿问题和挑战。

综上所述，吉林大学管理学院和商学院在专业方向、课程设置、教学方法、师资力量和研究方向等方面都存在明显的区别。学生可以根据自己的兴趣和职业规划选择适合自己的学院和专业方向。