二者的起点不一样。两年制本科是专起本，专科之后考的本科；四年制本科是高起本，即高中毕业之后考的本科。不论是哪种，毕业后的就业前景是一样的。也就是说，两年制专起本的本科毕业，其就业前景与四年制本科毕业的就业前景是一样的。