1）办理“在留资格”，审核机关是入管局，属于法务省管辖；换签的时候是在日本驻中国各地使领馆，这些使领馆属于外务省管辖；两个审核机关属于平行，所以都有可能发生电话调查这个事情；

2）办理在留来说，是在日本的8个入管局（再加2个支局）申请，相对来说，神户支局、大阪入管局、福冈入管局的调查电话比较多，尤其是大阪入管局和神户支局；审核来说，现在来看，横滨支局的审核比较严；

3）办理签证（换签）的时候，之前在其他的帖子说过，上海和重庆的电调比较多，北京的电调去年开始增多，而且对福建籍学生调查尤为重点关注；

办理在留的电调，以材料提交1个月之后尤其是在留下达20天之前最可能电调；办理签证（换签），一般只有5个工作日，所以材料提交使领馆第二天开始就准备好为宜，签证出来前一天电调可能性最大。

总而言之，接到调查电话也不要慌张，建议把提交的愿书、经费支付书、签证表 复印随身携带，按照提交材料内容回复即可，不用过于担心；祝你赴日求学一切顺利！