马来西亚多媒体超级走廊在发展过程中面临一些关键性的挑战:

首先，风险投资机制的不成熟是一个显著问题。1997年到1998年间，尽管马来西亚提供的风险资金总额有所波动，但与美国和新加坡相比，数额明显偏小。1990年至1999年，马来西亚的风险投资公司数量虽然有所增长，但马政府的参与度较高，国际金融机构的介入较少，这限制了其在全球风险资金竞争中的表现。

其次，信息通讯技术（ICT）人才的供需失衡也是一大挑战。根据MDC的数据，1998年至2005年间，马来西亚对ICT人才的需求量较大，但实际培养的毕业生数量仅能满足部分需求，存在4000人的缺口。专业分布方面，技术和软件类人才短缺，而系统分析和硬件工程师过剩，这需要进一步的教育和培训来调整。

最后，吸引国际ICT跨国公司的入驻潜力有待挖掘。在多媒体超级走廊中，ICT跨国公司的比例相对较低，尤其是北美和日本等拥有众多强大企业的地区。为了实现马来西亚在2010年成为国际ICT和多媒体服务中心的目标，马来西亚需要加大国际宣传力度，积极吸引这些跨国公司的入驻，以提升走廊的研发技术和管理水平。