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crRNA和tracrRNA是怎么融合成一条sgRNA的呢

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揭示sgRNA的神奇融合:crRNA与tracrRNA的巧妙结合

CRISPR-Cas系统中的核心元素,crRNA和tracrRNA,是如何神奇地融合成一条高效的sgRNA(小导向RNA)的?这背后是一场精密的分子舞蹈,让我们深入探索。

crRNA,源于CRISPR序列,是一段富含目标DNA序列信息的短RNA。它的主要任务是与目标DNA形成精确的碱基配对,仿佛是DNA上的精准寻址标签。而tracrRNA则是一条更为复杂的分子,它携带着与Cas蛋白结合的结构域,以及与crRNA重复区域互补的序列,就像一把钥匙,能精确地打开Cas蛋白的执行开关。

科学家们为了简化操作,将这两个分子巧妙地融合。他们通过设计DNA模板,将crRNA和tracrRNA的序列以及一个连接子(linker)无缝对接。这个模板经过转录,产生pre sgRNA,然后经过Cas9蛋白或其他核酸酶的加工,最终形成功能完备的sgRNA。连接子序列就像一个精巧的分子拼图,使得crRNA和tracrRNA的互补序列如同丝带般自然缠绕,形成复合体的雏形。

以一个实际案例为例,假设我们要对EMX1基因进行编辑,目标序列是:

5'-GGGACAGCTATCATGGCTAA-3'

crRNA的间隔区域则互补地编码为:

5'-TTAGCCATGATAGCTGTCCC-3'

选择一个tracrRNA序列,如:

5'-AAAAAAAGCACCGACTCGGTGCCACTTTTTCAAGTTGATAACGGACTAGCCTTATTTTAACTTGCTATTTCTAGCTCTAAAAC-3'

其结构域序列是:

5'-GTTTTAGAGCTAGAAATAGC-3'

连接子序列如5'-GAAA-3',则负责将这两个RNA片段完美结合。于是,DNA模板设计如下:

5'-TTAGCCATGATAGCTGTCCCGAAAGTTTTAGAGCTAGAAATAGCAAAAAAAGCACCGACTCGGTGCCACTTTTTCAAGTTGATAACGGACTAGCCTTATTTTAACTTGCTATTTCTAGCTCTAAAAC-3'

转录后的pre sgRNA经过加工,最终得到的就是能够精准引导Cas9蛋白的sgRNA,它携带着crRNA和tracrRNA的智慧,准备在基因编辑的舞台上大展身手。

这就是crRNA和tracrRNA融合成sgRNA的奥秘,看似简单的步骤背后,隐藏着生命的精密调控和科技的巧妙应用。这种分子层面的融合,无疑为基因编辑提供了强大的工具,推动着生物学和医学的前沿进展。