Gabrel6原本是我们“尽享社区”知道团队的，不过ta回答得不是太充分，所以自己再补充一下：

1、with的本义是“与什么在一起”，而in的本义是“在某个空间里”。with和in用于表达“用”的意思是借用出来的。类似地，by的本义是“在什么附近”，经借用后就表示“从旁边经过，经过，经由，通过”的意思。

2、这是一种“只保留相似的核心意思，而把与特征和要求有关的具体表象去除”的抽象用法。所谓“抽象”就是把可见的“象”（像的原字，起初是没有“像”这个字的，后来为了区分具体概念和抽象概念而造的）完全抽离（去除）掉，所以，抽象后的意思就只有相似的共同点，是更类似的本质的东西。比如说“互联网”的这个“网”字，它就已经抽象了，去掉了“绳索或线条”这些有形的物质，只留下它的结构和框架。

你说的句子中用with和in都是可以的，而且in也可以改成into都没问题，只不过他们强调的重点稍有不同：with强调“在一起”，也就是insect一直没有从beak里脱落；in强调“在里面”，而不是在其它地方或卡在某个别的地方；into强调“由外而入”（动作过程）。

所以，学英语一定要去理解单词（尤其是单词的本义），而不能老去死记硬背，否则，很多事情永远是模棱两可的。类似地，I am working on/with it这个句子中on和with都可以用，但表达的侧重点也是不同的。至于有何不同，就留给你自己去分析和思考一下。这样的训练对你理解英语是非常有好处的。欢迎交流。