初中生在拼写单词方面已经取得了一定的进步，但在熟练运用这些单词时仍然面临一些挑战。以下是一些可能的原因：

1.词汇量不足：虽然初中生已经学会了拼写单词，但他们的词汇量仍然有限。这可能导致他们在表达自己的想法时无法找到合适的词汇，从而影响他们的表达能力。

2.语法知识不扎实：除了词汇量之外，语法知识也是熟练运用单词的关键。如果初中生的语法知识不扎实，他们可能会在句子结构、时态和语态等方面出错，从而影响他们的表达效果。

3.缺乏实际运用场景：学习语言需要大量的实践。如果初中生缺乏实际运用英语的场景，他们可能会在口语和写作方面遇到困难。为了提高他们的实际应用能力，教师和家长可以鼓励他们参加英语角、观看英语电影和阅读英语文章等活动。

4.学习方法不当：有些初中生可能过于依赖死记硬背的方法来学习英语单词，而忽略了通过上下文理解和记忆单词的重要性。这种学习方法可能会导致他们在实际应用中遇到困难。因此，教师和家长应该引导他们采用更加有效的学习方法，如通过阅读和听力练习来学习和记忆单词。

5.缺乏自信：有些初中生可能会因为担心自己的英语水平不够好而不敢在课堂上或与他人交流时使用新学的单词。这种缺乏自信的心态可能会阻碍他们熟练运用所学的单词。为了帮助他们建立自信，教师和家长应该给予他们充分的鼓励和支持，让他们相信自己有能力学好英语。