你入境德国时间过了你签证的有效期吗？还是回程的时候才过有效期？

如果是前者，那你得从新办理签证，如果是后者，那是没有关系的。

你可以再次申请，说明因为行程有变化，但有效期已过，从新再办理。是的在准备一份资料吧。