永顺县移民开发局的机构设置主要包括以下几个部分：

1. 办公室: 主要负责协助局领导处理日常行政事务，确保信息畅通。它负责会议决策的跟踪落实、制度建设与完善，文书档案管理，包括收发文件、归档工作，车辆、档案、户籍和印鉴的管理，以及机关考勤。同时，办公室还负责人大、政协建议和提案的办理，以及政工、纪检、监察、工会和计划生育等工作。

2. 业务股: 负责移民工作业务的宣传推广，包括库区移民政策的普及。该股还负责农业技术培训，研究开发性移民新机制，推动库区经济发展，总结和推广移民工作经验，并协助上级业务部门进行培训工作。业务股对各移民站和乡镇进行业务指导。

3. 计财股: 主要负责库区的计划统计、资金争取和移民开发项目的财务管理。它指导移民资金使用，进行资金效益分析和监督，参与项目的可行性论证和验收，以及全县移民资金的稽核和内审。此外，计财股还负责库区投资统计和社会经济综合统计，对各移民站和乡镇进行业务指导。

4. 工程开发股: 负责基础设施项目的规划、设计和预算编制，对移民项目的审查上报进行监督。股内人员负责工程项目的实施、质检验收，以及全县移民开发项目的管理和年度计划编制。同时，协助计财股进行工程进度拨款，并负责库区植保、水面开发等服务工作，对各移民站和乡镇进行业务指导。

5. 其他: 移民公安执勤室作为局下属事业单位，承担着维护机关安全、打击犯罪、稳定库区秩序的任务。它负责保障机关人员及移民的安全，处理移民的信访工作，以及对各移民站和乡镇提供业务指导。