圣玛利亚女中创办于1881年，前身是文纪女中与俾文女中，校址在白利南路（今长宁路1187号）。

1851年，美国基督教圣公会琼斯女士在上海虹口礼拜堂后设立一座女校，命名为文纪。刚开始，文纪只有8名学生，上午学浅易的《圣经》和《四书》，其余时间学习纺织、缝纫、烹调、园艺等。10年后，另一名传教士——— 美国基督教圣公会格兰德女士，为纪念故世的丈夫俾文先生在上海又设立一座女校，并以其夫“俾文”名之。这里的女学生们除了学习圣经、国文、算术以外，还学习缝纫、刺绣。

1861年俾文女校创建。 1881年文纪、俾文两校合并成立圣玛利亚女中（St. Mary’s Hall），校址在万航渡路圣约翰大学校园内，第一年招生28人，首任校长为中国人黄素娥女士。

1881年6月，美国圣公会施主教将文纪、俾文两校合并，成立了圣玛利亚女校。新校舍建在梵王渡圣约翰书院后面，整个校园的建筑呈古希腊风格。此时的圣约翰书院和圣玛利亚女校仅一墙之隔，然而除了星期日在教堂分座“做礼拜”之外，男女学生从不允许交谈。学校开始时招生40余人，以后每年陆续增加。1931年6月25日圣玛利亚女校举行50周年校庆，此为学生表演。也是50年前即上海自有女校之初的女学生装束及其上课情形

1885年女校附设育婴堂，黄素娥兼管其事。

1900年，学校举行第一次毕业典礼，仅有一名学生朱静贞毕业。

1908年添设师范科、图书馆。此后圣玛利亚女校有较大发展，正式成立英文部、中文部和音乐部，学制定为8年。

1920年购买白利南路70亩地建造新校舍（今长宁路凯旋路口）。

1923年，圣玛利亚女校迁入白利南路(今长宁路)新校舍，并改名圣玛利亚女子中学，招生对象多为中上等家庭的女子。到1929年为止，学校共计有八年制毕业生100人，师范毕业生17人，初中毕业生137人，高中毕业生145人，中文特级毕业生63人。这时的圣玛利亚女校，已经成为一所贵族女子学校，学校完全按照美国式方法教育：除必修课外，还有宗教活动，家政训练和音乐舞蹈表演等选修课，传授西方上层社会的礼仪、社交知识。它一年学费一般学生是84元，相当于普通工人10个月的工资；专学西文的一年学费是168元，其他伙食、杂费尚且不包括在内。这样高的费用，普通人家显然是难以支持的。自此，圣玛利亚女中开始成为继中西女中后的上海第二所贵族教会女校。

钟楼

1937年借南京路大陆商场临时上课。

1939年圣玛利亚女校又在圣约翰大学校园里建斐蔚堂（Grave’s hall），学生全部走读。

1952年7月上海市教育局接管了中西女中和圣玛利亚女中，并把两校合并为上海市第三女子中学。 而原圣玛利亚女中的校址上则建立起了一所新的大专院校———上海纺织高等专科学校。

1999年8月，该校被并入东华大学，成为东华大学纺织学院长宁分校区，共占地面积64000平方米。

2009年，除了钟楼外，都是废墟。