早稻田大学孔子学院是一个重要的教育交流机构，由白井克彦担任理事长，他同时是早稻田大学的校长。白井校长与北京大学的杨河副理事长共同领导学院，杨河先生是北京大学校务委员会主任。

早稻田大学内部，土田健次郎担任常任理事，专注于教务工作；日方院长和常任理事堀口健治致力于开展研究；内田胜一则负责推动学院的国际化进程。日方副院长小口彦太和国际部长大野高裕也分别在他们的岗位上发挥着关键作用，留学中心所长白木三秀则在留学生事务上贡献力量。

北京大学方面，周其凤校长是学院的重要支持者，杨河先生同时担任校务委员会副主任。林建华担任常务副校长，李岩松作为校长助理兼国际合作部部长，对学院的发展提供战略指导。张秀环是汉语国际推广工作的重要负责人，王勇则是国际合作部部长助理和留学生办公室主任。科学与社会研究中心的周程副主任也为学院的学术交流提供了支持。