工程存档资料主要包括以下内容：

一、设计文件

工程存档资料的首要部分是设计文件。这类文件详细记录了工程项目的设计思路和施工过程，是工程建设的重要依据。包括设计图纸、设计方案、计算书等。这些文件详细描述了工程的整体布局、结构形式、设备配置等信息，为后续的施工和验收提供了明确的标准。

二、施工记录与资料

施工过程中产生的各种记录和资料也是工程存档的重要内容。包括施工组织设计、施工技术方案、施工进度计划、施工日志等。这些资料详细记录了施工过程中的各项操作、施工进度、人员配置及变更情况，反映了工程的实际施工情况，对于工程的质量控制和管理至关重要。

三、材料与质量证明文件

工程存档资料还包括使用的各种材料与相应的质量证明文件。包括材料采购合同、产品合格证、质量检测报告等。这些文件证明了工程所使用的材料符合相关规定和标准，是评价工程质量的重要依据。

四、验收文件

工程完成后，验收文件也是工程存档资料的重要组成部分。包括竣工验收报告、验收证书、整改通知及回复等。这些文件详细记录了工程的验收过程、结果以及存在的问题，是评价工程质量和安全性的重要依据。同时，也为今后的维护和管理工作提供了参考。

综上所述，工程存档资料涵盖了设计、施工、材料以及验收等各个环节的文件和资料，是工程项目管理的重要组成部分，对于保障工程质量、提高管理效率具有重要意义。