丹麦技术大学的学术组织架构经过改革后，采用了与私人公司相似的管理模式。原有的33个学术单位被重新整合为15个系或研究中心，这些机构涵盖了广泛的研究领域。

数学系专注于基础数学和应用数学的研究。信息技术和数学建模系则致力于信息技术与数学建模的交叉研究。土木工程系致力于基础设施和建筑技术的发展，纳米技术系则专注于纳米材料和纳米技术的应用。

建筑和能量系的研究重点在于绿色建筑和可再生能源技术。环境工程系致力于环境问题的解决，机械系则专注于机械设计与制造。制造工程和管理系结合了制造技术和管理科学，为制造业提供创新解决方案。

化学系和化工系的研究涵盖了从基础化学到化工过程的各个方面。电子工程系和电力工程系则专注于电子和电力技术的发展。生物中心、交通和运输中心以及微电子中心则分别关注生物技术、交通运输系统和微电子技术。

丹麦技术知识中心/图书馆为学生和研究人员提供了丰富的资源和信息支持。交通和运输研究中心则专注于交通运输系统的优化和改进。

丹麦芯片研究中心致力于半导体技术和集成电路的研发。化学工程学系则关注化学工程的理论与实践。制造工程及管理系则结合了制造技术和管理科学。

物理系专注于物理学的基础研究和应用。国家水资源实验室则关注水资源的管理与保护。环境资源实验室则致力于环境保护与资源管理。

信息与数学建模系则专注于信息科学与数学建模。微晶与纳米技术系则专注于微晶和纳米技术的研究。

这些研究机构共同构成了丹麦技术大学强大的学术网络，为学生提供了广泛的学术和职业发展机会。