在日本留学的费用大致包括学费、入学费、设施设备费等。第一年的平均费用如下：

对于国立大学的研究生院，费用为773800日元；公立大学的人文科学系研究生院则需要885939日元，社会科学系为837121日元，理学工学系为833113日元，农学药学系为999456日元，医学齿学系则需要844420日元。

私立大学方面，人文科学系研究生院的费用为891469日元，社会科学系为910587日元，理学工学系为1113454日元，农学药学系为1135493日元，医学齿学系则需要1124245日元。

如果选择学习日语，6个月课程的费用范围在357000至422000日元之间，1年课程的费用则在410000至1017100日元之间，1年半课程的费用则在590000至1451100日元之间，2年课程的费用范围则在770000至1720000日元之间。

在日本的生活费用方面，北海道约为122000日元/月，东京约为158000日元/月，中部地区约为124000日元/月，九州地区约为119000日元/月，全国平均则约为140000日元/月。

日本的宿舍通常较为紧张，尤其是在东京，连民宅都难以租到。在外租房也不便宜。例如，一间6叠（约9.6平方米）的公寓，仅房间租金（与厕所共用）每月不超过4万日元。若带有厨房和厕所，租金约为4万日元；带有浴室的租金则约为6万日元；如果包括冷热空调、厕所和浴室，则租金约为6.6万日元。

在日本租房时，除了租金外，还需支付相当于1-6个月房租的礼金，作为一次性费用给房东。还需支付1-2个月房租的押金，退租时可以部分退还。此外，还需支付给房地产公司相当于1个月房租的手续费。