项目管理责任制内容主要包括四个方面，旨在确保项目顺利进行并达到预定目标。第一部分是建设项目行政领导责任制，涉及部机关各司局领导及部直属事业单位法定代表人对本单位及省级农业行政主管部门分管领导对本省农业建设项目负责，建立监管责任人制度。同时，针对需要整改的项目，由项目行业主管司局负责整改方案、通知并监督完成。发展计划司负责整改工作的协调与审核。

第二部分是执行项目法人责任制，所有农业建设项目在立项前明确项目法人，全权负责项目申报、建设、资金管理及运行管理等全过程。对于项目管理不健全、财务管理混乱、工程质量问题的项目，追究项目法人责任。建设项目法人可由事业（企业）单位承担，或根据项目实际需要组建，但农业行政管理部门不宜作为项目法人。

第三部分是参建单位工程质量领导人责任制，农业建设项目中，勘察设计、施工、监理单位的法定代表人需对工程质量负领导责任。因工作失误导致重大事故的，除追究直接责任人，还要追究单位法定代表人责任。

第四部分是执行工程质量终身负责制，项目行政领导责任人、项目法人、勘察设计、施工、监理单位法定代表人需对其经手工程质量负终身责任。如遇重大质量事故，不论调职或职务变动，均需追究相应行政和法律责任。