增值税计税原理基于商品生产和流通中各环节新增价值或商品附加值征税。计算新增价值或商品附加值困难，故采用间接计算法，即以销售额为基础，扣减上一环节已缴增值税，余额即为纳税人需缴纳增值税额。这意味着增值税是销售货物或提供应税服务之外需缴纳的税种，属价外税范畴。

收取加工费的加工企业需针对所收取的费用开具增值税发票并缴纳税款。对于支付加工费的委托方，收到的增值税发票中所列税额可作为进项抵扣，这不代表真正缴纳增值税。此过程并非委托方直接支付增值税款，而是通过发票流程实现税款的计算和抵扣。

因此，委托方在支付加工费用时，支付的金额中包含了加工企业的增值税，这部分税款并非由委托方直接缴纳，而是通过加工企业开具的增值税发票进行计算和抵扣。委托方实际支付的费用和税额之间的关系需通过发票流程体现，体现为委托方支付费用中包含了加工费用和相应增值税。在合法交易中，这一流程确保了税收的合理征收和有效抵扣，维护了税法的公平性和完整性。