第一，地区间差异明显。这显然与人们对心理健康教育的认识程度以及地方经济发展程度有关系。

第二，总体上仍然在低水平操作，服务效果较差。从事服务的人员水平参差不齐，甚至有很大一部分人员连起码的心理学素养都没有，加上对心理健康认识上的偏差，导致我国学校心理健康服务总体水平低下。

第三，师资力量薄弱，教师数量明显不足。而且现有教师中，只有很少一部分教师具有心理教育专业毕业学历或接受过心理健康教育培训，造成师资队伍力量偏于薄弱。

第四，在实施辅导过程中往往偏重学校的作用，忽视家庭和社会的配合。

第五，缺乏必要的指导和监督。