栽培品种的退化，种子种苗的提纯复壮和优良种品选育工作滞后，造成中药材的质量不稳定：栽培品种经几年种植后，会出现产量、有效成分含量、抗病性能下降等种质退化现象，导致中药材生产产量低、质量不稳定、药材品质低劣。

由于大多数药用植物引种栽培历史较短，因此保留着许多野生性状，目前栽培的中药材种质混杂，表现为种内变异的多样性。种子种苗的提纯复壮和优良品种选育工作不及时，是造成中药材质量极不稳定的主要原因。